【忘れられた塔】
在塔的入口處，調查後使用「神秘の歯車」開門進入。
一路無障礙，到達塔最上階，時之祭壇，與大白對話發生劇情，隨後與カミュ對話2次，劇情中主角穿越時光，返回過去，目的拯救蘿莉小紅帽，改變歷史。但是在這之前，先整理下主角身上的裝備，將全部同班的最強武器防具都放在主角身上。
穿越時空的主角回到了過去時代，發現自己身處ゼーランダ山、聖地ラムダ。
前往大聖堂發生劇情後，與同伴們匯合，當然小紅帽蘿莉此時還依然神氣活現。
這裡雖然主角的等級延續沒變，但是其他同伴的等級回到了之前我們到達聖地時候的等級，等級雖然低了，但是裝備可以用，把之前從未來帶過來的高級裝備給同伴依次裝備。
隨後依據已經經歷過的歷史一樣，穿過ゼーランダ山，前往東南方位的始祖の森。
經過始祖の森，在天空の祭壇觸發劇情後，到達生命の大樹。
話不多說，來到生命大樹前，按照之前的經歷過的劇情，主角在取得勇者之劍的時候會受到偷襲，從未來歸來的主人公這次並沒有給偷襲者機會，偷襲未成，歷史改變，劇情切入BOSS戰。
有魔劍在手的主角，完全可以輕輕鬆松幹掉眼前這個25仔BOSS ホメロス(過去)。
而發現偷襲失敗的被魔王附身的國王，為了防止計畫敗露，直接殺人滅口幹掉了ホメロス，繼續扮演好好國王的角色，打算伺機謀取勇者之劍。
劇情後，主人公取得「勇者のつるぎ・真」。
【聖地デルカダール城】
使用傳送前往デルカダール城下町，進入北面デルカダール城，到達2層玉座の間發生劇情。
劇情後，前往2階貴賓室休息，正當主角休息時，假國王出現了，打算乘著主角休息時，偷取勇者之劍，幸好被小黑怪物妨礙。
同時，假國王也被眾人揭穿，眾人追趕國王至玉座の間，一場BOSS戰在所難免。
BOSS：魔道士ウルノーガ
本戰需要一定的打法，BOSS釋放紫色濃霧，會出現提示“回復效果翻轉”，此時如果治癒同伴則會直接減少對方HP，如果是補充MP則反倒是減少MP。
維持幾個回合，濃霧會變淡，此時可正常使用咒術、道具回復。
建議打法，群體攻擊輸出為主，再攻擊魔王的同時，以優先打掉魔王周圍的法杖為先。
戰勝BOSS後，未成形魔王被擊敗，第二天在玉座の間發生劇情。
隨後第8位同伴將軍再次加入。
由於主角一行人幹掉了魔王，歷史改變，勇者星在小黑怪物的召喚下墜地，更強大的敵人出現了……
眾人穿過デルカダール地方前往デルカコスタ地方。
デルカダール神殿發生劇情，乘坐鯨魚前往神の民の裡。
【神の民の裡】
這個時代由於阻止了魔王炸掉生命大樹，所以眾神健在。
進入深處的神苑發生劇情，隨後調查長老身前的寶箱取得「さいごのカギ」
太陽の神殿內取得「聖なる種火」
隨後需要調查3根苗木，劇情後獲得導きの木
苗木1位於ドゥルダ郷，直接傳送過去
苗木2，乘坐鯨魚前往バンデルフォン東北高臺，調查高臺的苗木
苗木3，乘坐鯨魚前往ダーハラ西北高臺，調查苗木。
【神の民の裡】
調查全部3棵苗木後返回神の民の裡，前往神殿與長老對話，劇情後獲得「神秘の歯車」
乘坐鯨魚前往命の大樹北面的忘れられた地，使用齒輪進入忘れられた塔。
【忘れられた塔】
塔最上階，時之祭壇與大白時の番人對話，劇情後，鯨魚覺醒，裝備黃金聖衣……
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接下來我們可以直接去空中突入邪神領域，進入最終戰，迎接真結局。
也可以調查神殿內苗木接受最多5次試煉
更可以前往之前魔王主線中的我們去過的全部城鎮，依次經歷由於改變歷史產生影響的各城鎮相關劇情。
會有不同劇情的城鎮：
イシの村
ダーハルーネの町
グロッタの町
デルカダール城
プチャラオ村
ソルティコの町
ユグノア城跡
白の入り江
海底王國ムウレア
風穴の隠れ家
クレイモラン城
聖地ラムダ
ドゥルダ郷
ホムラの裡
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裡BOSS戰 邪神
成員配備：小紅帽、セーニャ、シルビア、主角勇者
輸出主要依靠小紅帽的全體爆炸攻擊，シルビア負責解除異常狀態增攻，セーニャ負責治癒增防，主角負責扔勇者劍、治癒、輔助攻擊。
見到邪神後，第一回合，操作主角時，使用道具選擇「勇者のつるぎ・真」，使用「勇者のつるぎ・真」後，BOSS實力大減，戰鬥正式打響。
